ميشائيل هنکه سال 2011 به عنوان مربي استقلال تهران شروع به کار کرد. او فوتبال را براي مسئولان و بازيکنان ايراني فعلا بيش از هر چيز موقعيت خوبي براي پول درآوردن ميداند. به گزارش ايسنا دستيار سالهاي پيش اوتمار هيتسفلد و پرويز مظلومي در گفتوگويي با دويچهوله به پرسشهايي درباره فوتبال ايران پاسخ داد. هنکه در بخشي از اين مصاحبه گفته است: «از فعاليتم در ايران پشيمان نيستم؛ هر چند تنها و دور از خانواده در ايران اقامت داشتم. حضورم در ايران برايم با کاهش کيفيت زندگي همراه بود، زيرا در ايران نميتوانستم خيلي از کارهايي را که دوست دارم، انجام دهم. خوشبختانه رابطه خوبي با علي فتحا...زاده، مديرعامل باشگاه استقلال دارم. رسما در کنار فعاليتم به عنوان مربي همچنين در سمت مشاور مديرعامل نيز انجام وظيفه کردم. اين باعث شد که از لحاظ پرداخت حق و حقوقم در فصل گذشته، نسبتا کمتر مشکل داشته باشم اما حقيقت اين است که قسمتي از حقوقم از سال گذشته، هنوز پرداخت نشده است. در فصل جاري نيز همچنان با باشگاه استقلال قرارداد معتبر دارم. اما قاطع اعلام کردم تا وقتي که طلبهاي حقوقيام از فصل گذشته پرداخت نشود، از ادامه فعاليت در استقلال فاصله ميگيرم. در اين زمينه با فدراسيون جهاني فوتبال نيز مشورت کرده اما هنوز اقدام قانوني يا شکايتي عليه باشگاه استقلال نکردهام.» هنکه درباره بايکنان ايراني گفته است: «خيلي از فوتباليستهاي ايراني از قابليت بالاي تکنيک انفرادي برخوردارند. اين نکته قابل مقايسه با خصوصيات تکنيکي فوتباليستها در اروپاست اما بايد اضافه کنم که تکنيک انفرادي فوتباليستهاي ايراني بعضي وقتها باعث تکروي بيش از حد آنها و از بين بردن نمايش فوتبال سازنده و منطقي نيز ميشود. البته فوتبال در ايران فعلا براي مسئولان و بازيکنان موقعيت خوبي براي پول درآوردن است.»